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cabファイルでインストールするとプログラム削除で“MyCompany プログラム名”と出るのでぐぐった
http://www.opennetcf.org/forums/topic.asp?TOPIC_ID=1081
要するに

• obj/Release/の下のProjectName_PPC.infというファイルを修正。
  • [Version]Provider
  • [CEStrings]AppNameやら[CEStrings]InstallDirとかも変更してみたりー
• BuildCab.batで再度作成
• Visual Studioでcab作ると上書きされるおまけ付き！

だって。